新兖镇为及时了解农民身体健康情况和方便对农民进行健康教育及治疗，坚持不懈,不断完善农民健康档案工作，全镇建档率达99%以上。
新兖镇整合镇卫生院、计生、新农合、民政等部门，发挥镇各部门的作用，逐年对51个行政村的农民进行详细统计，农民健康档案不断完善。农民基本健康档案已家庭为单位，采集家庭成员的基本情况、健康状况、吸烟史、疾病家族史、儿童计划免疫、新农合参合情况等基本信息。
镇卫生院与各相关部门紧密配合，明确专人对档案进行管理，不断对村民档案进行更新，确保档案发挥作用。镇计生办深入扎实开展好春、夏、秋季计划生育集中活动，对全镇1万多名育龄妇女进行了全部健康查体，利用指纹录入系统进行甄别，杜绝了替代查体现象的问题；利用B超、胸透等仪器进行健康查体，对育龄妇女身心健康起到了促进作用，对育龄妇女的信息做到了精细化管理。新农合加强对群众的就医人群的管理，把相关信息及时更新到健康档案。镇民政部门加强对低保户、特困家庭的管理，把关心他们的身心健康做为救助的重要部分，打牢他们增收致富的基础。该镇还积极发挥其他社会医疗保障资源，协调邀请了济宁人民医院、兖州市人民医院等医院的专家深入社区，开展免费给群众查体活动。广大医务志愿者也深入村庄社区一线，向广大村民宣传健康生活理念，特别针对一些有高血压、糖尿病、肝炎、结核妇女病等常见病进行免费健康体检，帮助农民群众及时了解病情，并提出合理化治疗建建议和预防措施，受到广大群众的欢迎。
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