引起月经不调的原因有两大类：
1、神经内分泌功能失调引起：主要是下后脑--生茶杯-卵巢轴的功能不稳定或是有缺陷，即月经病。
2、器质病变或药物等引起：包括生殖器官局部的炎症、肿瘤及发育异常、营养不良;颅内疾患;其他内分泌功能失调如甲状腺、肾上腺皮持功能异常、糖尿病、席汉氏病等;肝脏疾患;血液疾患等。使用治疗精神病的药物;内分泌制剂或采取宫内节育器避孕者均可能发生月经不调。某些职业如长跑运动员容易出现闭经。此外，某些妊娠期异常出血也往往被误认为是月经不调。
临床上诊断神经内分泌功能失调性的月经病，必须要排除上述的各种器质性原因。
哪些原因可引起月经不调? 激素的问题
许多女性有过这样的经验：少女时代刚开始有月经的时候，月经往往不准时，一两年以后，即使没有治疗也会变得正常。
因为这个时候女性体内还没有建立起激素平衡状态，所以月经不规律。女性在刚出现月经时，不是每个月都会排卵。而卵巢却会生成雌激素，使得子宫内膜生长、变厚，如果没有按时排卵，内膜就会不停地生长，当月经相隔几个月才来时，出血量会非常大、出血时间也很长。
因此青春期女孩子月经不规律是很常见的，一两年后就会变得正常。但如果出血量很大，应该尽快看医生，通常在一两天内就能止血。
卵巢、子宫疾病
卵巢、子宫出现问题往往会反应在月经改变上，如卵巢囊肿、子宫肌瘤、子宫腺肌病等，这些问题引起的月经不调，必须先治疗原发病，原发病消除后，月经自然回到正常。
压力
虽然我们还不能确认过多的压力对人体到底有多少影响，但它确实可以影响到女性的月经规律。很大一部分女性在刚进入大学或更换新的工作后，面对新的环境、工作压力等问题时，会出现月经不调。
可能是压力影响脑部化学物质的分泌，以及脑垂体所释放的女性激素，结果是月经变得不规律。一段时间后，随着压力缓解，月经也恢复正常。
药物
并不是只要吃药就会引起月经不调，只是一部分药物会影响月经规律，如镇静剂、安眠药、抗抑郁药等。会影响脑部分泌性激素，所以月经周期可能会因此受到影响。
如果服用这些药物时，出现经常性或不规则出血，甚至月经干脆不来，一般来说不必担心。但患者可能会很担心月经问题，使得问题更加严重。到底药物和压力哪一个引起月经改变，有是很难分清楚，需要和医生讨论。
甲状腺功能异常
甲状腺出现问题似乎在女性身上更多见一些，不论是甲状腺功能亢进，还是甲状腺功能低下，都会影响月经。甲状腺功能亢进时，月经次数减少、月经量减少、两次月经相隔时间变长。而甲状腺功能低下时，经血增多，出血时间长，但久病的患者月经会变少，甚至月经不来。
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