对接受基因治疗的艾滋病患者长期随访的结果表明，遗传修饰T细胞是一项安全的基因疗法。这或许能部分消解近年来人们对于基因疗法的过度疑虑。
上世纪九十年代，基因疗法首次用于治疗“重度联合免疫缺陷症”（SCID），至今已经进行了两千余例的人体试验。早期临床试验表明，基因疗法在治疗白血病、血友病、地中海贫血、帕金森症、阿尔茨海默病等上效果显著，甚至能够令盲人重获光明。而更多的动物模型试验显示，基因治疗大有根治更多顽疾的可能。
安全性问题
可以说，基因疗法承载了现代医学治愈顽疾的诸多希望。但是，由于该疗法涉及对患者的遗传物质进行操作。所以，基因疗法自诞生之日起，其安全性也备受关注。
迄今为止，在基因疗法完成的两千余例人体试验中，共有12例发生严重的不良反应，如免疫排斥或T细胞白血病等。这其中，“乔妮·莫尔之死”（参见《南方周末》2007年8月22日科学版）的影响最为深远。2007年7月美国马里兰州一位36岁的关节炎患者，在接受基因治疗时意外死亡，继而引发美国对相关基因疗法的重新审查。至此，公众对基因疗法的信心降至谷底。
虽然，进一步的研究发现：乔妮·莫尔的死因与基因疗法并无直接关系。此后基因疗法在临床上也不断取得成功，甚至，在2009年被《科学》、《时代》周刊同时评为“十大科学突破”。但是，相当一段时间内，公众对于基因疗法的安全性还是心存疑虑。
基因疗法需要借助病毒载体，将外源基因导入患者的受体细胞。在此过程中，源于病毒的载体会不会对患者造成伤害？导入的外源基因会不会引起机体的免疫反应？外源基因整合至基因组后，会不会造成基因重排？这是否有进一步诱发机体发生癌变的可能？等等。
由于基因疗法尚处于早期研究阶段，缺乏大样本的临床试验数据，以上问题很难用公众信服的数据直接回答。
2012年5月《科学·转化医学》杂志发表的论文，对逾十年基因治疗受试者的血液样本进行分析，得出结论——“T细胞遗传修饰是一种安全的基因疗法”。这或许能部分消解近年来人们对于基因疗法的过度疑虑。
十年临床数据
宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院的布希曼教授（Frederic D. Bushman）为研究基因疗法的长期有效性和安全性，对接受基因治疗的HIV阳性患者进行长期随访。这些患者在1998—2005年间分别接受了一次或数次“T细胞免疫重建”。这种基因治疗是采用传统的逆转录病毒载体，将嵌合抗原受体基因导入患者体内，该嵌合抗原受体能引导机体的免疫系统杀伤HIV感染的细胞。
布希曼教授的研究结果表明：患者在接受基因治疗十年后，导入外源基因依然能够发挥治疗效果。数据显示，该基因疗法的半衰期可达16年，这表明该基因疗法在患者体内的有效作用时间可达十余年。
更令人振奋的是，对43名患者，累计逾500个患者随访年的样本进行分析，无论是外源基因的插入位点分析，还是临床血液学检测，均未发现患者体内发生了癌变或显著的免疫反应。这意味着，“逾十年的临床数据证明，遗传修饰T细胞是一项安全的基因疗法”。
“安全港”在哪里
由于目前基因疗法中，外源基因的整合位点存在一定的随机性。这往往是基因疗法发生不良反应的主要原因。此前多起不良反应，均是由于外源基因的插入激活了整合位点附近的“原癌基因”，而导致患者体内发生癌变。
2002年法国8名“重度联合免疫缺陷症”患者接受基因治疗，虽然病情得到缓解，但是，随后有4名患者患上了T细胞性白血病。进一步的研究发现，逆转录病毒载体整合至基因组的过程中，激活了整合位点附近的原癌基因（LMO2），这导致了受试者体内T细胞增生，并最终患上白血病。
克隆增殖试验证明，类似“LMO2”，基因疗法中载体能够直接激活的“原癌基因”至少还有“MECOM”、“PRDM1”等。而人类基因组中与癌症相关的基因总数约2700多个，占到人类基因组基因总数的10%。
如何在进行基因治疗时，避开这些“陷阱”，显得至关重要。近年来，随着基因靶向技术的发展，科学界开始尝试通过优化外源基因的整合位点，来提高基因疗法安全性。
布希曼教授一直致力于此方面研究。2012年1月，他在《自然·癌症》杂志发表论文，提出了基因整合“安全港”（safe harbours）的概念。如果将负责转移外源基因的病毒载体比作“轮船”，载体整合至基因组的位置便是轮船靠泊的“港口”，而基因组上那些远离“原癌基因”的位点就被称为是“安全港”。利用基因定点整合技术，将外源基因整合至基因组的“安全港”，基因治疗中就可以避免上述悲剧的重演。
布希曼教授进一步定位了人类基因组上三个可能安全港（AAVS1、CCR5、ROSA26）。倘若这些外源基因整合的“安全港”，能得到进一步的验证，那么有了“靶标”的基因疗法，也许将更加安全、有效。
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