韩国《朝鲜日报》报道指，韩政府6月26日在国务会议上秘密通过韩日《军事情报保护协定》，政府获得总统李明博的同意，并在日本也通过内阁审议后，原计划当月29日下午签署。
在距预定的签署仪式(4点)10分钟前的下午3点50分(当地时间)，韩国外交通商部发言人赵炳珶表示：“由于国会7月2日开院，决定在与国会协商后来推进签署。”
报道称，因为韩国在野党提出反对，紧接着执政党新世界党也表示“虽然不反对协定内容，但首先应与国会协商”，要求推迟签字。
其后日本官房长官藤村修举行记者会，表示“本来期待今天内签署，非常遗憾”。
批评大多认为，根本原因在于韩国政府的推进方式。过于在意舆论而小心翼翼地进行，给人“想要偷偷签署不正当协定”的印象。尤其是非公开提交国务会议(6月26日)进行审议，在签署之前想要突然袭击式地公开的计划导致反对强烈。
韩国《中央日报》分析称，韩国舆论对日本也持否定态度。韩国政府无法说服在大选之前对舆论比任何时候都要敏感的政界。一位不愿透露姓名的国策研究院研究委员表示“同盟的基本是军事合作，军事同盟的基础是情报合作”，在强调协定必要性的同时却表示“不考虑与日本围绕过去历史的特殊性而推进签署协定是勉强的做法”。
韩国民主统合党要求国务总理金滉植辞职和李明博向国民道歉。他们还要求彻底放弃协定，而不是推迟签署。金滉植在当晚发表的报道资料中表示：“因为程序上的问题，给国民造成了意想不到的担心，对此感到很抱歉。”金滉植还解释称，“考虑到了在对方国相关程序没有结束的状态下互不公开的外交惯例”，“今后将以负责的态度处理”。
报道称，今后，该协定将由韩国国会外交通商统一委员会和国防委员会进行审议。但对于该协定的必要性和可行性，朝野存在巨大分歧，预计将很难达成一致。如果舆论恶化，协定可能很难签署。 相关阅读