2016年，济宁医学院面向全国招收全日制临床医学硕士专业学位研究生预计招生规模59名(含推免生)，实际招生名额以教育部下达的正式招生计划为准，各专业招生名额将根据考生初试和复试成绩进行适当调整。招收专业有内科学、外科学、影像医学与核医学、精神病与精神卫生学、临床病理学、神经病学等专业。
根据国家相关规定，济宁医学院录取的硕士研究生可享受或申请研究生助学金、研究生学业奖学金、研究生国家奖学金或通过其他途径获得资助。其中，研究生助学金用于资助全国普通高等学校纳入全国研究生招生计划的非定向全日制研究生(档案转入济宁医学院且无工资收入)，每生每年6000元。研究生学业奖学金是入学第一年第一志愿优先评选，后续根据研究生学业成绩、科研成果、社会服务等因素进行评定，用于奖励支持研究生更好地完成学业。奖学金金额分别为8000元/年、6000元/年、4000元/年，获奖人数约占非定向全日制研究生(档案转入济宁医学院且无工资收入)总人数的65%。而且，据国家财政部、教育部下达奖励名额，学校择优评定，每生每年可获得2万元国家奖学金。(记者 曹俐)
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