2009年2月，朝鲜整合人民武力部下属侦察局、劳动党下属作战部等部门，成立朝鲜人民军侦察总局，金英哲被任命为局长，李善权进入该局工作。也是从此时开始，金正恩作为朝鲜最高领导人继承人的地位日渐明确。
包括美国《时代》周刊和《华盛顿邮报》在内的西方主流媒体多报道称，李善权的军衔为“退伍上校”。但韩国政府文件显示，2010年金英哲晋升上将军衔时，李善权被晋升为大校。韩联社曾援引其消息源称，2016年离开军队前，李善权的最终军衔可能是将军级。
2010年后，李善权与金英哲的“交集”逐渐明朗。当年，朝韩就开城工业园区“三通”（通行、通信、通关）进行工作层面磋商时，李善权任朝方代表团团长。而开城工业园区“三通”，正是金英哲在2008年前后的一系列朝韩将军级会谈中与韩方代表达成的共识。
值得注意的是，2010年11月朝韩进行工作层面军事会谈时，朝方团长李善权虽然保有军衔，但向韩方通报的职务是“国防委员会政策局官员”。国防委员会是金日成执政后期设立的朝鲜最高行政机关，金正恩上台后于2016年将之改组为国务委员会。
“像李善权这样的人物，都有多重身份：他们大多都有军衔，偶尔也会穿上制服，但他们最重要的身份是劳动党内的人，军队和政府（的身份）是次要的。”曾多次访问平壤的美国朝鲜问题专家马克·巴里告诉《中国新闻周刊》。他还指出，李善权最终成为了“金英哲的左右手”。
权起植也透露：“（我身边）很多人说，李善权是金英哲的助手。”而在2012年金正恩成为朝鲜最高领导人后，金英哲的地位迅速提升。
2015年12月29日，朝鲜劳动党中央政治局委员、党中央书记、统一战线部部长金养健在一次意外事故中去世。半年后，金英哲在劳动党七大上当选为中央政治局委员、党中央副委员长兼统战部部长，并进入最高人民会议常任委员会和国务委员会，接替金养健成为朝鲜统一事务的总负责人。
又过了半年。2016年11月，朝鲜天道教青友党中央委员长、长期参与朝韩交流的柳美英去世。出席葬礼的韩方代表惊讶地发现，脱去军装的李善权紧随金英哲步入灵堂，并向南方宾客自我介绍称：“我是朝鲜祖国和平统一委员会委员长”。
暴躁的谈判者
2018年12月26日的朝鲜开城，天气寒冷，朝鲜半岛东西部铁路公路对接项目开工仪式举行。作为出席仪式的朝方最高级别官员，李善权在韩国记者的镜头前面带微笑、挥手致意。
这是李善权最后一次以祖国和平统一委员会委员长身份出现在韩国代表、统一部长官赵明均面前。此后，朝韩关于东西部铁路公路对接项目的磋商陷入停滞。
祖国和平统一委员会是朝鲜处理朝韩关系的领导机构。麦登向《中国新闻周刊》介绍，该机构是一个由各种社会团体组成的联盟，由朝鲜劳动党中央委员会统一战线部领导，其高层几乎都是统战部的官员，李善权则直接向统战部部长金英哲汇报。
据《劳动新闻》报道，李善权本人也从2016年12月起兼任争取韩朝和平与统一联席会议朝方筹委会副委员长等职，通过官方和民间渠道展开对韩工作。
李善权就任祖国和平统一委员会委员长后，该机构曾三次向韩国释放谈判信号。2017年6月21日，委员会向刚刚上台的韩国总统文在寅喊话称，“在这一命运的交叉口，南朝鲜当政者应迈出负责任的步伐”。
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